Thứ trưởng Nguyễn Viết Tiến cho biết, sau khi nghiên cứu vụ việc, đối chiếu các văn bản quy phạm pháp luật hiện hành, Bộ Y tế đã đưa ra quan điểm xung quanh vụ việc. Theo đó, “việc đồng chí Phạm Văn Tác tổ chức lễ tạ đền Bảo Lộc thờ Đức thánh Trần là việc của cá nhân, gia đình đồng chí, không liên quan đến công việc của ngành y tế. Nội dung bài báo nêu việc tổ chức lễ thực hiện từ 12h đến 17h30 ngày thứ 7 (1/10), đó là ngày nghỉ, ngoài giờ làm việc theo quy định của nhà nước. Vấn đề tín ngưỡng là của cá nhân, đã được Nhà nước quy định tại Pháp lệnh của Ủy ban thường vụ Quốc hội về tín ngưỡng, tôn giáo, trong đó có vấn đề tín ngưỡng cá nhân”.
Bên cạnh đó, trước đây báo Người Tiêu dùng đã có một số bài phản ánh việc của ông Phạm Văn Tác về một số vấn đề công tác tổ chức cán bộ khi chưa được kiểm chứng. Bộ Y tế vẫn đang tiếp tục xác minh những đơn thư tố cáo”. Về phía ông Phạm Văn Tác cũng khẳng định: Những thông tin trang mạng đưa không đúng sự thật, có sự quy chụp. Không có chuyện hầu đồng ở đây. Gia đình ông đến đền thờ đức thánh Trần Hưng Đạo để đi lễ cầu an. Đây là chuyện hết sức bình thường.
Bộ Y tế đã đề nghị Ban Tuyên giáo T.Ư, Bộ Thông tin và Truyền thông với vai trò quản lý báo chí, chỉ đạo các cơ quan báo chí đưa tin trung thực, khách quan các vấn đề của ngành y tế. Công văn nêu rõ: “Trong trường hợp báo Người Tiêu dùng không cung cấp đủ bằng chứng để chứng minh, đề nghị Ban tuyên giáo T.Ư, Bộ Thông tin và Truyền thông xử lý nghiêm theo đúng quy định của pháp luật nhằm bảo vệ lợi ích chính đáng của cán bộ, công chức ngành y tế”.